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Emerging Infectious Disease Test Markets



TABLE OF CONTENTS

Executive Summary . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1

Emerging Infectious Diseases: The Need For Better IVDs. . . . . . . . . .1

Emerging Infectious Diseases: Identifying And Meeting The Threat. . . . .2

Emerging Infectious Diseases: Microbes And Their Geography. . . . . . . .4

        Streptococcus A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  4

        Hepatitis E, F, G And X.. . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  4

        Helicobacter Pylori. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5

        Lyme Disease . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5

        Periodontal Disease. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5

        Mycobacterium tuberculosis (TB). . . . . . . . . . . . . . . . . 5

        STDs: Chlamydia . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .6

        STDs: Genital Herpes Simplex. . . . . . . . . . . . . . . . . . .6

        STDs: Human Papillomavirus. . . . . . . . . . . . . . . . . . . .6

        STDs: Human Immunodeficiency Virus. . . . . . . . . . . . . . . .7

        Miscellaneous Bacteria, Viruses And Parasites. . . . . . . . . . 7



Geographic Distribution Of Misc. Bacteria, Viruses, Parasites And Fungi  8

                Bacteria. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .8

                Parasites And Fungi . . . . . . . . . . . . . . . . . . .9

                Viruses . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10



Chronic Fatigue Immune Dysfunction Syndrome (CFIDS) . . . . . . . . . . 12

        Introduction. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12

        Company Developments. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 13



Helicobacter pylori . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15

        Introduction. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 15

        H. Pylori And Gastric Cancer. . . . . . . . . . . . . . . . . . 16

        Treatments. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16

        Testing For H. pylori . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17

        Testing Demand: From Resistance To Acceptance . . . . . . . . . 18

        Company Efforts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19

        Testing Market. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21

        Testing As A Replacement For Endoscopy. . . . . . . . . . . . . 22

        Testing Market Estimates. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22

        Potential Market For H. Pylori Testing. . . . . . . . . . . . . 23



Hepatitis, New Viral Types. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24

        Introduction. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24

        Newly Discovered Viruses. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 24

        Hepatitis D Virus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25

        Hepatitis E Virus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 25

                Company Developments. . . . . . . . . . . . . . . . . . 26

        Hepatitis F Virus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 27

        Hepatitis G Virus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 28

        Genelabs' Hepatitis "X" Program . . . . . . . . . . . . . . . . 28



Lyme Disease. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30

        Introduction. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 30

        Problems With Early Tests . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 31

        Government And Academic Developments. . . . . . . . . . . . . . 33

        Company Developments. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35

        Test Comparisons. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 37

        PCR Tests . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38



Periodontal Disease . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 40

        Introduction. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 40

        Commercial Developments.. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 40

        PCR Testing . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 46

        Treatment . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48

        The Potential Market. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 49



Sexually Transmitted Diseases (STDs). . . . . . . . . . . . . . . . . . 50

        Introduction. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 50

        Chlamydia . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 50

                Chlamydia Tests . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 52

                Chlamydia DNA Probes. . . . . . . . . . . . . . . . . . 53

        Herpes. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55

        Genital Herpes Simplex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 56

                Tests For Herpes. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 56

        Human Papillomavirus  . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 59

        Human Immunodeficiency Virus. . . . . . . . . . . . . . . . . . 61

                HIV: Screening Tests. . . . . . . . . . . . . . . . . . 62



Streptococcus A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64

        Introduction. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64

                The Need For Rapid Tests. . . . . . . . . . . . . . . . 65

                Relative Market Share . . . . . . . . . . . . . . . . . 66



Mycobacterium tuberculosis (TB).  . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 68

        Introduction  . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 68

        The Market For Tests  . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 69

        Company Developments  . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 69

        Tests For Drug Resistance . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 76

        Mycobacterium Differentiation . . . . . . . . . . . . . . . . . 78



Miscellaneous: Bacteria, Chlamydiae And Rickettsiae . . . . . . . . . . 81

        Introduction  . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 81

        Aeromonas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 81

        Campylobacter jejuni  . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 82

        Chlamydia pneumoniae (TWAR strain)  . . . . . . . . . . . . . . 83

        Clostridium difficile . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84

        Ehrlichia chaffeensis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 87

        E. coli O157:H7 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88

        Haemophilus influenzae biogroup aegyptus  . . . . . . . . . . . 91

        Legionella pneumophila. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 92

        Mycoplasma pneumoniae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 94

        Listeria monocytogenes. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 95

        Staphylococcus aureus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 96

        Vibrio cholerae . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 98

        Vibrio vulnificus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 99



Emergent Protozoans, Fungi And Helminths. . . . . . . . . . . . . . .  101

        Anisakis. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  101

        Babesia . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  102

        Candida . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  103

        Cryptococcus. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  107

        Cryptosporidium . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  108

        Giardia lamblia . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  110

        Microsporidia . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  112

        Plasmodium. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  113

        Pneumocystis carnii . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  117

        Strongyloides stercoralis . . . . . . . . . . . . . . . . . .  119

        Toxoplasma gondii . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  120



Emergent Viruses. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  123

        California Serogroup Viruses. . . . . . . . . . . . . . . . .  123

        Chikungunya Virus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  123

        Crimean-Congo Hemorrhagic Fever Virus . . . . . . . . . . . .  124

        Dengue Virus. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  125

        Filoviruses . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  126

        Hantaviruses. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  128

        Human Parvovirus B19. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  129

        Human T-Cell Leukemia Virus . . . . . . . . . . . . . . . . .  131

        Influenza A Virus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  136

        Japanese Encephalitis Virus . . . . . . . . . . . . . . . . .  139

        Lassa Virus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  140

        Measles Virus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  141

        Norwalk . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  144

        Rabies Virus. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  145

        Rift Valley Fever Virus . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  146

        Ross River Virus. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  147

        Rotavirus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  148

        Venezuelan Equine Encephalitis (VEE) Virus. . . . . . . . . .  149

        Yellow Fever Virus. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  150

Company Directory . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  151



Index . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .  163

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